第50集 神奇宝贝华丽大赛，秋叶大会
小智等人终于抵达秋叶镇。小遥二度挑战的神奇宝贝华丽大赛即将开始。在神奇宝贝中心，小智等人认识带着恰雷姆的协调训练家葛蕾丝。葛蕾丝给了小遥许多善意的建议，然而，却反而成了小遥的压力。为了抗压，小遥一大早就带着狩猎凤蝶做练习。差不多在这时候，神奇宝贝中心里面，小智与小瞬也展开了战斗……。
第51集 对抗恰雷姆，华丽对战!
小遥与狩猎凤蝶二度挑战的神奇宝贝华丽大赛，秋叶大会终于开始了。第一次审查时，竞敌小瞬跟葛蕾丝都以美丽的绝招得到高分。轮到小遥的狩猎凤蝶时，苦练的成果也让她得到高分，成功晋级第二次审查。第二次审查时，小遥的第一关的对手，是第一次审查时的最高分得主，武藏野。小遥是不是能够打赢武藏野呢？
第52集 正电拍拍与负电拍拍，应援之道？
神奇宝贝华丽大赛结束，为了小智的下一场道馆挑战赛，一行人向着釜炎镇的方向持续旅行。途中，与带着正电拍拍与负电拍拍的和智重逢。和智在修行的旅行中加入了当地的应援团。关户团长的应援理念乍听之下冠冕堂皇，但是小胜等人却觉得其中一定有问题。为了拆穿关户团长的谎言，小智等人与委托应援团加油的火箭队展开战斗…。
第53集 向尾喵与猫之手，呆火驼的牧场
为了前往烟突山，小智一行人走在有「热焰小径」之称的洞窟里，遭受大群熔岩虫的追击，逃到一座山坡上的牧场。在那里，小智等人遇到饲育呆火驼的阳子，借宿一夜。小遥为了让向尾喵体验真正的战斗，和阳子展开比赛。小遥让向尾喵使出绝招「协助」，但还是被阳子善战的大尾立给逼进苦战。当天晚上，不明人士为了得到呆火驼，偷偷潜入牧场。
第54集 火岩队再度杠上水舰队！烟突山的战斗！
小智等人一路向下一个道馆所在地釜炎镇旅行，来到了烟突山的山麓。一行人向着山顶前进，途中缆车突然停了下来。用紧急电话求救，也迟迟没有响应。于是小智就一个人离开缆车，出去求救。此时，在火山口附近，为了得到学者索蓝斯博士发现的陨石，火岩队与水舰队展开了战斗。
第55集 新人道馆训练家亚莎，满地坑洞的战斗场地
小智等人来到釜炎镇后马上来到釜炎道馆。可是与道馆训练家亚莎到了战斗场地后，才发现不只战斗场地破烂不堪，而且连个裁判都没有。与亚莎聊天，得知道馆本来由她的祖父穆拉爷爷主持，但是就在三天前，穆拉爷爷已突然将道馆交给亚莎，外出旅行去了。被留下的亚莎，满脑子只想着怎么让自己的神奇宝贝变强。此时，外出旅行的穆拉爷爷又因为担心亚莎而折回釜炎道馆。出去短短几天就折回来，穆拉爷爷觉得无脸见众人，决定伪装身份，默默关心亚莎。但是……
第56集 烈焰徽章！在燃烧的战斗中获得！
小智等人终于迎接攸关丰缘地方第四个徽章的道馆挑战赛。对刚成为训练家的亚莎来说，这是她的第一场道馆比赛。相对的，小智已经有很多比赛经验，所以可以说是自信满满。比赛刚开始时，小智针对火系神奇宝贝使用战术获得了领先。但是得到前道馆训练家穆拉爷爷建议的亚莎，也渐渐的沉着下来，开始对大意轻敌的小智展开攻击。
第57集 许多的晃晃斑。寻找幸福，到山的那一边
决定以橙华道馆为下一个目标后，小智等人从釜炎镇出发了。它们在山路上遇到许多只晃晃斑。其中有一只额头还长着罕见的心型斑点。此时一心想抓住有心型斑点的晃晃斑的女性，爱莉出现了。但心型斑点的晃晃斑又跑进树丛里面不见踪影。小智等人从大感困扰的爱莉口中了解原因，得知那只晃晃斑是某人托付给爱莉保管，今天必须要还给对方。于是小智等人就和爱莉一起开始寻找有心型斑点的晃晃斑。
第58集 突破钢之谷！煤炭龟对抗大钢蛇！
小智等人以橙华道馆为目标旅行。虽然选择经往紫菫市的路径，但是途中还是迷路了。然后，撞见石炭神奇宝贝的煤炭龟遭到几只神奇宝贝的围攻。小智等人救了煤炭龟，注意到这地方是有强烈地盘意识的钢神奇宝贝居住的钢之谷。急着赶往紫菫市的小智等人，决定与救起的煤炭龟一起穿越山谷，但是…。
第59集 再访紫菫道馆，vs雷电兽
为了得到第五个徽章而向橙华市前进的小智等人，来到了路途中的紫菫市。久没有在大城市中逛逛，无意中发现有许多种类的游乐设施的游乐场。小智拿出神奇宝贝球叫自己的神奇宝贝出来，一起玩游戏。谁知，整个游乐场就是火箭队设下的陷阱。神奇宝贝们都被抓走了。救出这些神奇宝贝的，是以前在紫菫道馆交手过的道馆训练家铁旋。小智为了测试新同伴煤炭龟的能力，向铁旋提出挑战，做练习赛……。
第60集 向尾喵与优雅猫，传说的神奇宝贝协调训练家登场
小智等人向着即将举办神奇宝贝华丽大赛的绿荫镇前进。但是，与火箭队的战斗使得向尾喵嗓子出了问题，一行人遂决定到附近的神奇宝贝诊所看看。向尾喵在经过治疗后恢复了健康。小智等人得知这位负责治疗的女性，是有名的传说的协调训练家绫子时，跟她问了许多的问题。但是，可疑的阴影也正悄悄靠向他们……
第61集 戴面具的协调训练家，假面使者登场
小智等人终于抵达即将举办神奇宝贝华丽大赛的绿荫镇。来到神奇宝贝中心时，发现小遥的竞敌小瞬的毒蔷薇受伤了，在那里接受治疗。小瞬在跟戴假面具的训练家对战中落败，无法参加这次的华丽大赛。小智等人听到后，对这个打败强敌小瞬的戴面具的训练家，假面使者，感到很好奇。然后，假面使者也找上了小智一行人……。
第62集 绿荫镇，神奇宝贝华丽大赛
小智等人来到即将举办神奇宝贝华丽大赛的绿荫镇。在那里认识了软弱的少年君麻吕。他的母亲很讨厌神奇宝贝，还对君麻吕下了禁令，不准接近神奇宝贝。小智等人知道君麻吕很喜欢神奇宝贝，遂与他的父亲田村麻吕合作，想让君麻吕参加神奇宝贝华丽大赛。另外，这次的绿荫大会里，对第一次与向尾喵搭档参赛，以缎带勋章为目标的小遥来说，也是很重要的一场比赛。小遥与君麻吕的竞赛的结果将是如何呢？
第63集 太阳岩与莲帽小童，神圣森林的传说
为了下一场道馆挑战赛，小智向着橙华市前进，途中路过森林深处的一个小村子。在那里，小刚的莲叶童子进化成莲帽小童。村民们看到莲帽小童，不知为什么，就开始拜了起来。好像是因为村子从两星期前就开始缺水，所以村民们才如此崇拜村子的水神莲帽小童。村民们认为缺水的原因是两周前出现在森林的太阳岩，因而想尽办法想将太阳岩赶出森林……。
第64集 青绵岛的天空，小遥的心
以橙华市为目标前进的小智等人，途中在森林迷路，发现了一只受伤的青绵鸟。牠好像是因为前几天的暴风雨而受伤、离群的。于是小智等人决定照顾到青绵鸟身体康复为止。因为小智等人努力的照顾，青绵鸟的伤势好了，将要回到同伴的身边了。可是，不知为什么就是飞不上来，掉到地上。小智等人虽不晓得原因，但还是拟立了种种作战计划，想让青绵鸟可以再度飞翔。
第65集 击退溶食兽大作战！
前往下一个都市橙华市的途中，小智等人来到了某个城镇，突然听到神秘的警报声。据君莎小姐所说，这个城镇一到某个特定时期，就会有大批溶食兽来袭，抢夺镇上的粮食。由于迄今为止的受害太过严重，镇上已委托溶食兽研究家的释吉博士，决定这次一定要击退溶食兽。小智等人得知此事，想要助博士一臂之力，但是……。
第66集 一触即发，爆音怪对抗森林蜥蜴
以橙华市为目的地的小智等人，中途在某个森林用早餐。一行人都很快乐，唯独木守宫的情况怪异。牠对小智所说的话几乎完全没有反应。这时候，爆音怪大吼大叫的跑出来。听跟着跑过来的少年盖伊说，这个爆音怪最近都无视自己的训练家盖伊说的话，非常狂暴。盖伊搞不清楚原因，非常困扰。小智猜测原因应该是压力太大，想要化解其压力，而决定跟盖伊来一场比赛。结果直到刚才都还很安静的森林蜥蜴突然斗志高昂，要求小智派自己上场。于是小智就派森林蜥蜴上场了，可是……。
第67集 跳舞战斗!乐天河童!
小智等人终于来到橙华市。在那里，小智对自己的神奇宝贝们，介绍由木守宫进化成功的森林蜥蜴。大家都露出欢迎的态度，不知为什么，唯独龙虾小兵除外。这时候，树林间出现带着乐天河童的蓄胡须的男子，潘裘。潘裘提出以午饭为赌注来比一场。小智认为这是道馆赛之前的练习好机会，答应比赛。小智本想派森林蜥蜴战斗。然而龙虾小兵突然抢在森林蜥蜴前头，要求让自己出赛……。
第68集 爸爸是偶像?冒牌的道馆训练家
小智等人为了参加橙华市的道馆赛，来到了邻镇的北橙华市。一行人还没到神奇宝贝中心，市民见到小遥与小胜就一阵骚动。因为二人是该市市民崇拜的道馆训练家「千里」的子女，而大受欢迎。火箭队见状，想出了一个计划。情势促使下小遥在众人面前表演神奇宝贝的绝技。而小智，则受到某个训练家要求比赛……
第69集 橙华道馆的危机，家庭危机!
为了向千里再度挑战道馆赛，以得到第五个徽章，小智来到了橙华市。这地方对小遥小胜来说，是令人怀念的故乡。小遥等人回到家里，期待着与父母的重逢，然而，家里却找不到父亲。千里的身影。小遥感觉到母亲美津子的神色不同往常。好像是因为千里与乔伊小姐有外遇的样子。看似亲密的二人之间到底发生了什么事呢？在同一时期，火箭队潜入了橙华道馆巨大的温室，想夺走懒人翁、过动猿、与请假王……
第70集 橙华道馆赛第五个徽章
攸关第五个徽章的战斗终于在橙华市展开了。道馆训练家是小遥与小胜的父亲千
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